Processo de Transcrição e Tradução em Eucariotos

Upstream: região antes do gene
Downstream: região após o gene
TATAbox: localizado no promotor na posição -10( 10 pares antes do início da transcrição) em procariotos.
RNA polimerase ll: sintetiza RNA mensageiro.
Há o reconhecimento e ligação na sequência no DNA próximo ao promotor.
Promotor: fragmento que está upstream ao gene, e não é transcrito.
RNA polimerase: complexa; com subunidades e são chamadas de holoenzimas (apresentam vários domínios e formam complexos que representam a enzima como um todo.)
Acoplamento de subunidade Sigma acontece no resto do complexo do RNA polimerase para que a polimerase reconheça o TATAbox. A RNA polimerase terá que desacoplar da subunidade Sigma para conseguir caminhar sobre o gene, caso contrário ficará retida no promotor.
RNA polimerase vai abrir a dupla fita e criar bolhas de transcrição e aí sintetizar o RNA.
Parada de transcrição:
Mecanismo intrínseco : determinado ponto do gene que a RNA polimerase encontra pares de base CG e depois sequências de adenina.
RNA mensageiro terá esses pares CG e essa sequência de uracila.
RNA polimerase chega nesse ponto onde há uma sequência de adenina (DNA) e uracila (RNA) por ser uma interação fraca, ela volta para corrigir e encontra uma estrutura de grampo, estrutura fechada. Logo, se solta e se desliga da molécula de DNA.

Mecanismo Rho dependente: RNA possui um sítio para fator Rho, quando esse sítio é reconhecido ela vai atrás da RNA polimerase induzindo seu desligamento.
Diferenças de procariotos e eucariotos na transcrição:
Procariotos: sem núcleo, sem sítio específico para a transcrição ocorrer. DNA no citoplasma, logo será lá que vai ocorrer esse processo de transcrição e tradução.
Eucariotos: RNA mensageiro é gerado dentro do núcleo e exportado do núcleo para o citoplasma onde estão os ribossomos que a tradução vai acontecer.
Eucariotos: transcrição
Começa com um promotor e uma sequência TATAbox dentro do promotor, assim como nos procariotos
Acontece a ligação da proteína de ligação ao TATAbox, a partir dessa ligação vai se juntar as proteínas de fatores de transcrição que vai se ligar ao DNA e vão ser centrais no processo de transcrição pais são regulatório que podem estimular ou inibir a síntese de um gene, regulam o processo de transcrição.
Aparato basal ou complexo iniciador de transcrição: TBP+Fatores de transcrição+ RNA polimerase.
Cauda do RNA polimerase se fosforila, permite que o RNA polimerase se desligue do aparato basal de transcrição e passe a andar no gene para fazer molécula de RNA mensageiro.
RNA nos eucariontes será processado
Primeiro o pré RNA será feito e depois será processado.
Capeamento: adição do grupamento químico 7-metilguanosina que é uma guanina metilada na extremidade 5' (CAP)
Funções: proteção e reconhecimento de RNA pelo ribossomo para iniciação da tradução.
Adição da cauda Poly A na extremidade 3'- sequências de adeninas que vão ser adicionadas no RNA mensageiro.
Splicing- remoção de introns (não codificam)e união dos exons (codificam).
Splicing alternativo: diferentes maneiras de associar os exons.ex.: (actina no neurônio, pele e músculo/ mesmo gene e ações diferentes).
Spliceossoma: complexo de várias proteínas e vários RNA's com atividades de enzimas U1 e U2 são moléculas do spliceossoma que se ligam nas sequências conservadoras (no ponto de união de introns e exons e na adenina no meio do intron) depois dessa ligação acontece outras ligações de outras subunidades do spliceossoma que também são moléculas de RNA. (Formando complexo capaz de catalisar essa reação de remoção do intron. Nesse movimento a adenina reage com a guanina que está na interseção e forma uma estrutura fechada chamada de laço de cowboy. (Remoção do intron)
Na segunda reação a extremidade 3'-OH livre que sobrou do primeiro exons vai reagir com o segundo ponto de interseção que une o intron do outro lado com o segundo exon. Esse exon gera um corte Donington na outra ponta e os exons vão se juntar e o intron será removido.
5'UTR e 3'UTR são sequências não traduzidas- servem para os ribossomos conseguir localizar o centro com a região codificadores. (São as reguladoras, permitem que o ribossomos se ligue e desligue da molécula de RNA mensageiro.)
Introns auto removíveis : protozoários faz um splicing que não depende do spliceossoma, seu próprio RNA mensageiro faz sua autocatálise, removendo seus íntrons.

Tradução
Processo pelo qual a mensagem de RNAs mensageiros forma proteína para executar uma determinada função.
Início da síntese- ribossomos procura uma sequência de bases no RNA mensageiro específica. (AUG) start côdon metionina.
Côdon de parada- UAA, UAG e UGA. Eles não codificam aminoácidos
Côdon degenerado: existe mais de um codom possível para codificar um mesmo aminoácido
Aminoacil tRNA-sintetase: são responsável por identificar o anticôdon do RNA transportador e de acordo com anticôdon eles colocam uma molécula de aminoácido correspondente a esse anticôdon.
Ribossomos- organela que sintetiza proteína.
Ribossomos eucariontes e procariontes
Procariontico: 70S eucariontico: 80S
Ribossomos é formado por duas subunidades, uma maior e outra menor, a menor é a primeira a se ligar no RNA mensageiro.
Depois que a tradução é finalizada, o ribissomos vai embora para procurar uma nova sequência de RNA mensageiro para fazer outra tradução.
RNA mensageiro fica ligado ao ribossomos durante a tradução.
Quando o RNA já está ligado o ribossomos vai percorrer o RNA mensageiro sempre na direção da extremidade 5' para extremidade 3'
Estrutura interna do ribossomos- 3 sítios:
Sítio A: "A" vem do aceptor, recebe o RNA transportador carregando o aminoácido
Sítio P: Acontece a ligação peptídica com os aminoácidos que estão chegando, a proteína é sintetizada.

Sítio E: "E" exit- saída, RNA transportador vai sair por ele já sem aminoácidos, pois já foram incorporados na proteína.
Fatores de iniciação de tradução
Proteínas que são conhecidas como fatores de iniciação que são fundamentais no processo de início de tradução.
Fase de alongamento: movimento do ribossomo fazendo a tradução
Sítio A está vazio, chega um RNA transportador carregando aminoácido. No sítio P já havia um RNA transportador com a metionina ligada. Ocorre a ligação peptídica entre a metionina e o outro aminoácido, o ribossomo vai andando sintetizando a proteína e sai no sítio E.
Modificações pós-traducionais Fosforilação: adição de fosfato
Desfosforilação: remoção de fosfato
Ubiquitinação: modificação de proteína de agrupamentos Ubiquitina. Todas que as possuem estão marcadas para morrer.